預防食源性疾病最有效的方法是遵循“食品安全五要點”：
（1）保持清潔
這條要點看似容易，做起來卻很難，具體而言主要有兩個小點，一是大家從小就都知道“餐前便后要洗手”，手衛生尤為重要；除此之外，做飯過程中也要注意洗手，尤其是生熟食品交替處理的過程。二是帶有食物殘渣的器皿、刀具、抹布、砧板都可能會成為細菌孳生的溫床，需經常清潔消毒，保持干凈，不要讓它們成了污染源。另外，廚房和儲存食物的地方要注意防蟲防鼠，寵物也不要讓它們到廚房。
（2）生熟分開
生熟不分是細菌性食源性疾病發生的主要原因，做好生熟分開是預防細菌性食源性疾病發生的關鍵。處理生的肉、魚、蔬菜的器具如果直接處理熟食，生食中的細菌就可能會污染熟食，最好使用兩套刀具、器皿、案板等分別處理生、熟食品，不能混用，如果實在做不到，也可以先用清潔的器具處理熟食后，再處理生食。
（3）燒熟煮透
燒熟煮透（食物中心溫度至少達到70℃，持續時間至少1分鐘）可殺死食品中可能污染的大部分致病微生物。特別需要提醒的是，制備大塊肉、整雞、整魚時一定要徹底加熱，才能將其內部的細菌殺死；冰箱里存放的剩菜剩飯不宜貯存太久，超過24小時就要徹底加熱后再食用。
（4）保持食物的安全溫度
絕大多數致病微生物喜歡室溫環境，70℃以上和4℃以下可以抑制大部分致病微生物的生長。家庭要特別注意以下幾點：熟食在室溫下存放最好不超過兩小時；熟食和易腐爛的食物應及時冷藏。冰箱并不是保險箱，即使在冰箱中也不能過久儲存食物；冷凍食物不要在室溫下長時間化凍。
（5）使用安全的水和原材料
對于家庭來講，最重要的就是不吃超過保質期和變質的食物。還要記住一點，符合安全標準的自來水是最好的消洗劑，水果和蔬菜要用清潔的自來水沖洗，尤其是生食更要注意，先用水浸泡，再仔細清洗。生菜、白菜、韭菜等葉菜類是先將葉片分別剝開后，浸泡數分鐘，再以流水仔細沖洗。蘿卜、土豆等根莖類，是利用軟刷直接在水龍頭下刷洗。橙、柚、柑桔等須去皮的水果類，可用軟刷輕輕刷洗。葡萄、蕃茄等不須去皮的水果類，則先浸泡后，再水洗。
